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证据等级

多靶点预测给出一长串蛋白以后，哪些仍只是候选

分类器可以扩大搜索范围，但训练标签、适用域与独立实验决定预测能否成为机制证据。

预测列表不是作用机制清单

多靶点模型会为同一化合物计算多个潜在蛋白关系，适合在早期形成候选范围。分数来自训练数据中的结构与活性模式，不代表化合物已经在细胞、组织或人体中与这些蛋白发生有效作用。

模型输出应标明“候选”，并保留训练标签定义。以结合实验为标签的模型，与以细胞活性为标签的模型，支持的结论并不相同。

适用域决定模型是否见过类似化学空间

当查询分子与训练集合距离过远时，分类器仍可能输出数值，但这个数值缺少足够参照。适用域可以从指纹相似度、特征范围、模型一致性和不确定度等角度估计。

低相似度并非候选一定错误，它表示模型需要更谨慎地使用。新骨架可能带来真正创新，也可能超出模型能够判断的区域。

多个分类器同意仍需要看共同偏差

朴素贝叶斯、树模型和其他分类器若使用相同训练数据，可能共享标签错误与覆盖偏差。四个模型投票一致，提高的是算法层面的稳定性，不自动形成四份独立证据。

更强的支持来自不同数据类型：结合实验、细胞响应、结构证据、遗传扰动与时间顺序。它们回答不同层面的关系，不能被单一综合分数取代。

药物再定位最怕忽略剂量与组织条件

一个已知化合物被预测连接新靶点，只是再定位假设的开始。实际暴露浓度、代谢、组织分布和安全窗口可能让这个关系无法在真实条件中出现。

优先级排序应把可达到浓度、靶点表达、疾病相关性和现有安全资料放在模型分数旁边。只按算法排名挑选前十名，容易把可计算性误当成可实施性。

AlzhCPI留下的是方法问题

AlzhCPI曾以多靶点QSAR和多组分类器组织化合物—蛋白候选。当前站点不恢复其模型或医疗用途，而是保留一个重要方法问题：预测结果如何经过适用域、外部证据和实验设计逐层升级。

任何涉及疾病与治疗的结论都必须回到正式研究和专业审查。资料平台能够解释证据层级，不能替代医疗判断。

证据等级任务登记表

下面各项帮助团队把当前判断重新连接到设备、文件或模型条件。实际项目可以删减无关字段，但未知条件应明确标记，不要凭经验补齐。

项目复核理由处理方式
查询化合物查询化合物决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少查询化合物时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明查询化合物由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
标准结构当标准结构发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一标准结构条件。若两份标准结构无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
盐形式盐形式无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的盐形式会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
立体异构复核立体异构时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份立体异构记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
训练标签训练标签决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少训练标签时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明训练标签由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
活性阈值当活性阈值发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一活性阈值条件。若两份活性阈值无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
阴性定义阴性定义无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的阴性定义会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
训练时间复核训练时间时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份训练时间记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
模型版本模型版本决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少模型版本时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明模型版本由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
特征空间当特征空间发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一特征空间条件。若两份特征空间无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
适用域适用域无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的适用域会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
最近邻距离复核最近邻距离时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份最近邻距离记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
模型一致性模型一致性决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少模型一致性时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明模型一致性由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
概率校准当概率校准发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一概率校准条件。若两份概率校准无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
不确定度不确定度无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的不确定度会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
靶点名称复核靶点名称时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份靶点名称记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
蛋白亚型蛋白亚型决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少蛋白亚型时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明蛋白亚型由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
物种当物种发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一物种条件。若两份物种无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
组织表达组织表达无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的组织表达会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
可达浓度复核可达浓度时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份可达浓度记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
代谢稳定性代谢稳定性决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少代谢稳定性时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明代谢稳定性由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
结构证据当结构证据发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一结构证据条件。若两份结构证据无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
结合实验结合实验无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的结合实验会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
细胞实验复核细胞实验时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份细胞实验记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
遗传扰动遗传扰动决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少遗传扰动时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明遗传扰动由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
剂量反应当剂量反应发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一剂量反应条件。若两份剂量反应无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
时间顺序时间顺序无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的时间顺序会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
脱靶风险复核脱靶风险时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份脱靶风险记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
独立文献独立文献决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少独立文献时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明独立文献由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
候选等级当候选等级发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一候选等级条件。若两份候选等级无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
验证优先级验证优先级无法确认时应标记未知范围，不用默认值隐藏资料缺口。未知的验证优先级会降低结论等级，却比一个未经核实的确定答案更可靠。后续补齐信息时，应新增修订记录并说明它改变了哪些判断。保留旧值、新值和修改原因，不直接覆盖早期记录。
结论边界复核结论边界时要查看它和相邻步骤的关系，单独一个数值不足以支持结论。若两份结论边界记录彼此冲突，应保留差异并回到产生环节核对。只有来源与时间顺序清楚以后，才决定哪一项进入正式版本。无法确认时暂停下游使用，并标出当前影响范围。
审查角色审查角色决定接收者能否还原当前条件，应与原始来源同时保存。缺少审查角色时，即使文件本身完整，也无法确认它是否属于当前任务。团队还应说明审查角色由谁产生、在什么阶段冻结，以及后续哪些结果依赖这项记录。写入来源清单，并与原始对象使用同一任务编号。
更新日期当更新日期发生变化时，保留前后版本与原因，避免把方法变化误写成样本变化。比较结果前先确定两侧使用的是同一更新日期条件。若两份更新日期无法统一，应分别报告对应条件下的结果，而不是合并成一个平均结论。安排另一位成员抽样核对，记录复核时间与结论。
本文讨论一般研究与设备方法，不提供医疗诊断，也不代表旧科研工具仍在运行。涉及正式项目时，应以当前软件说明、数据授权和专业审查为准。

需要把模型条件放进实际交接时，可参考国际任务指南；设备与文件来源问题则见客户端下载说明。

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